A Dishonored 2 elődje után 15 évvel veszi fel a fonalat: Lord Regent nincs többé, a rettegett patkánypestis már csak a történelemkönyvek lapjain található meg. Az egykori császárnő, Emily Kaldwin trónját azonban egy bitorló szerezte meg, így a Szigetek sorsa veszélyben van. Emily Kaldwinként vagy Corvo Attanóként hagyd el Dunwall városát, és fedezd fel Karnacát, az egykor élettől pezsgő tengerparti várost, amely Emily hatalomba való visszahelyezésének kulcsát őrzi. Vadászd le ellenfeleidet, és változtasd meg a Birodalom sorsát örökre!